ZespóÅ‚ badaczy, w skÅ‚ad którego wchodzÄ… przedstawiciele Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego, Uniwersytetu Medycznego w Warszawie i MiÄ™dzynarodowego Instytutu Biologii Molekularnej i Komórkowej, dokonaÅ‚ bezprecedensowych osiÄ…gnięć w zakresie cyrkularyzacji mRNA – czÄ…steczki dostarczajÄ…cej lecznicze geny. Jej kolista struktura uzyskana przez naukowców przyczynia siÄ™ do wydÅ‚użenia czasu życia RNA, a co za tym idzie, dÅ‚uższej produkcji biaÅ‚ek terapeutycznych. Jest to przeÅ‚omowe dokonanie, które jest ważnym krokiem w projektowaniu nowej generacji leków RNA. W przyszÅ‚oÅ›ci mogÄ… wspomóc leczenie genetycznych chorób rzadkich, w tym mukowiscydozy.
W pracy pt. „Chemical circularization of in vitro transcribed RNA for exploring circular mRNA design” opublikowanej 12 lipca br. na Å‚amach czasopisma „Nature Communications” opisano kilka bezprecedensowych osiÄ…gnięć w cyrkularyzacji RNA, w tym chemicznÄ… cyrkularyzacjÄ™ mRNA kodujÄ…cego biaÅ‚ko peÅ‚nej dÅ‚ugoÅ›ci, chemicznÄ… cyrkularyzacjÄ™ in vitro RNA, rozwój kolistych RNA, które ulegajÄ… translacji zależnej od CAP-u, oraz cyrkularyzacjÄ™ modyfikowanego RNA.
– Cyrkularne RNA jest nietypowÄ… formÄ… informacyjnego RNA. WystÄ™puje ono w naturze, odkryto to stosunkowo niedawno, ale od kilku lat rozważa siÄ™ również wykorzystanie terapeutyczne takiego mRNA. IstniejÄ… metody biochemiczne jego syntezy, ale to podejÅ›cie ma pewne wady. GÅ‚ównÄ… jest miÄ™dzy innymi to, że cyrkularne RNA ulega translacji jak RNA wirusowe. Natomiast żeby to cyrkularne RNA ulegaÅ‚o translacji tak jak nasze ludzkie RNA w komórkach, to należy tam zamontować strukturÄ™ CAP-u – wyjaÅ›nia w rozmowie z agencjÄ… Newseria prof. dr hab. Jacek Jemielity z Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego. – To, co my zrobiliÅ›my, to po raz pierwszy zamknÄ™liÅ›my olbrzymie i bardzo wrażliwe czÄ…steczki, jakimi sÄ… RNA, metodami chemicznymi w kóÅ‚ko. To powoduje, że mogliÅ›my tam wprowadzić strukturÄ™, która jest odpowiedzialna za translacjÄ™ w taki sposób, jak siÄ™ to dzieje u ludzi.
Translacja to proces rozszyfrowywania informacji zawartej w mRNA, na podstawie której dochodzi do produkcji biaÅ‚ek. NiezbÄ™dny jest do tego CAP (czapeczka), czyli struktura znajdujÄ…ca siÄ™ na koÅ„cu podÅ‚użnego RNA. Badacze utworzyli kóÅ‚ko i do chemicznego kolistego RNA zamontowali CAP. Jest to możliwe do przeprowadzenia tylko za pomocÄ… chemii.
– Cyrkularne RNA ma szereg zalet. NajważniejszÄ… jest to, że jest pozbawione koÅ„ców, a w mRNA sÄ… one najsÅ‚abszymi ogniwami, od nich rozpoczyna siÄ™ degradacja. DziÄ™ki temu, że udaÅ‚o nam siÄ™ wyeliminować te koÅ„ce, łączÄ…c je ze sobÄ… i zamykajÄ…c RNA w kóÅ‚ko, w takiej formie może ono trwać w komórkach dÅ‚użej i dziÄ™ki temu biaÅ‚ko również może powstawać znacznie dÅ‚użej – tÅ‚umaczy prof. Jacek Jemielity.
W ten sposób RNA sÅ‚uży dÅ‚użej jako matryca do produkcji biaÅ‚ek. W przypadku niektórych sekwencji mRNA ilość wyprodukowanego biaÅ‚ka dla RNA, które „zamkniÄ™to w kóÅ‚ko” , w porównaniu do prekursorowego mRNA liniowego byÅ‚a nawet do 370 razy wiÄ™ksza.
Naukowcy do stworzenia kolistej struktury RNA wykorzystali metodÄ™ chemicznÄ… – reakcjÄ™, która byÅ‚a na tyle Å‚agodna, aby nie uszkodzić czÄ…steczki RNA niezwykle wrażliwej na różnego typu warunki. Naukowcom wydawaÅ‚o siÄ™, że na wiÄ™kszych czÄ…steczkach spotkanie dwóch koÅ„ców jest maÅ‚o prawdopodobne. Dlatego prace rozpoczÄ™to od bardzo krótkich, kilkunastonukleotydowych fragmentów RNA.
– Ku naszemu zaskoczeniu to dziaÅ‚aÅ‚o caÅ‚kiem nieźle. Natomiast oczywiÅ›cie sytuacja mogÅ‚aby siÄ™ zupeÅ‚nie zmienić, kiedy przechodzimy do takich mRNA, które już kodujÄ… jakieÅ› biaÅ‚ka – to sÄ… RNA o dÅ‚ugoÅ›ci 1 tys. lub 2 tys. nukleotydów, najdÅ‚uższe, jakie testowaliÅ›my, to byÅ‚o 4 tys. nukleotydów RNA kodujÄ…ce szczepionkÄ™ przeciw COVID-owi – mówi badacz. – ByliÅ›my niezwykle zaskoczeni tym, że mimo że czÄ…steczka jest olbrzymia i te dwa koÅ„ce muszÄ… siÄ™ ze sobÄ… spotkać, żeby przereagować, to ta reakcja zachodziÅ‚a niezwykle efektywnie. Wydajność procesu cyrkularyzacji przekraczaÅ‚a nawet 60 proc.
Jak podkreśla, przeprowadzone badania pokazały, że bardzo wrażliwe cząsteczki RNA mogą ulegać reakcjom chemicznym.
– Kiedy rozpoczynaliÅ›my ten projekt, to ta myÅ›l wydawaÅ‚a siÄ™ zupeÅ‚nie szalona. To otwiera zupeÅ‚nie nowÄ… drogÄ™ w myÅ›leniu o modyfikacjach RNA do zastosowaÅ„ terapeutycznych – mówi ekspert z z Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego.
JeÅ›li chodzi o wydÅ‚użenie czasu życia mRNA, pojawiajÄ… siÄ™ nowe możliwe zastosowania tej technologii w leczeniu, które do tej pory byÅ‚y jedynie rozważane.
– SÄ… to rzadkie choroby genetyczne, czyli choroby, w których terapeutyczne biaÅ‚ko musi być dostarczane znacznie dÅ‚użej niż w zastosowaniach szczepionkowych, ponieważ tamto biaÅ‚ko terapeutyczne musi być produkowane przez caÅ‚e życie pacjenta. WiÄ™c to liniowe RNA, które Å‚atwo ulega degradacji, Å›rednio nadaje siÄ™ do takich zastosowaÅ„ – podkreÅ›la prof. Jacek Jemielity.
Jednym z przykÅ‚adów jest mukowiscydoza – choroba pÅ‚uc, w której biaÅ‚ko bÄ™dÄ…ce transportem jonów jest zmutowane.
– Jedna cegieÅ‚ka w tym biaÅ‚ku jest podmieniona na innÄ… i to już powoduje dysfunkcjÄ™. PomysÅ‚em na leczenie tego typu chorób jest dostarczanie RNA kodujÄ…ce prawidÅ‚owÄ… formÄ™ tego biaÅ‚ka – wyjaÅ›nia ekspert.
Naukowiec podkreśla, że badania nad kulistą formą RNA wciąż są w początkowej fazie. Kolejnym celem zespołu badawczego jest m.in. podniesienie wydajności procesu cyrkularyzacji do nawet powyżej 80 proc.
– BÄ™dziemy również pracować nad zwiÄ™kszeniem aktywnoÅ›ci biologicznej. Pierwsze testy in vivo na myszach pokazujÄ…, że nasze cyrkularne RNA jest aktywne biologicznie, ale teraz bÄ™dziemy optymalizować strukturÄ™ tego RNA, żeby produkcja biaÅ‚ka nie tylko trwaÅ‚a znacznie dÅ‚użej, ale również byÅ‚a jak najwydajniejsza – tÅ‚umaczy prof. Jacek Jemielity. – Ostatnim etapem bÄ™dzie oczywiÅ›cie pokazanie zastosowaÅ„ cyrkularnego RNA, czyli już w tej chwili myÅ›limy o tym, na jakim modelu choroby chcemy pokazać, że ta technologia dziaÅ‚a lepiej od tego, co już istnieje na rynku.
